Namalowane na czerwono, słowo „VON” to wszystko, co pozostało po ataku terrorystycznym na obiekt jądrowy w Japonii. Rząd jest zszokowany swoją bezradnością, a policja frapuje się w poszukiwaniu sposobów na stłumienie sprawców. Publiczność jest zdezorientowana – aż do momentu, gdy sześć miesięcy później w internecie pojawia się dziwny film. W nim dwaj nastoletni chłopcy, którzy identyfikują się jedynie jako „Sfinks”, bezpośrednio wyzywają policję, grożąc sprowadzeniem zniszczeń i chaosu na Tokio. Niezdolna do szybkiego powstrzymania masowej paniki szerzącej się po mieście i desperacko szukająca jakichkolwiek tropów w śledztwie, policja z trudem działa przeciwko tym terrorystom, a detektyw Kenjirou Shibazaki znajduje się w samym środku tych wydarzeń. Zankyou no Terror opowiada historię Nine i Twelve, dwóch chłopców stojących za zamaskowanymi postaciami Sfinksa. Nie powinni istnieć, a jednak stoją mocno w świecie oszustw i tajemnic, podczas gdy miasto wali się wokół nich, wszystko w nadziei na pochowanie własnej tragicznej prawdy.