Dr Kenzou Tenma, elitny neurochirurg niedawno zaręczony z córką dyrektora szpitala, jest na dobrej drodze do awansu w szpitalnej hierarchii. Wszystko się zmienia pewnej nocy, gdy pozornie drobny incydent na zawsze zmienia życie dr Tenmy. Gdy przygotowuje się do wykonania operacji, otrzymuje telefon od dyrektora szpitala, który każe mu zamienić pacjentów i zamiast tego wykonać ratującą życie operację mózgu u słynnego artysty. Jego koledzy po fachu, narzeczona i dyrektor szpitala brawują jego osiągnięcie; jednak z powodu tej zamiany ginie biedny robotnik imigrant, co powoduje u dr Tenmy kryzys sumienia. Gdy pojawia się podobna sytuacja, dr Tenma trzyma się swoich zasad i decyduje się wykonać operację na młodym chłopcu, Johan Liebercie, zamiast na burmistrzu miasta. Niestety, ten wybór pociąga za sobą poważne konsekwencje dla dr Tenmy – jedną z nich jest utrata pozycji społecznej. Jednakże po tajemniczej śmierci dyrektora i dwóch innych lekarzy pozycja dr Tenmy zostaje przywrócona. Nie mając dowodów na jego winę, zostaje zwolniony i w końcu obejmuje stanowisko dyrektora szpitala. Dziewięć lat później, gdy dr Tenma ratuje życie przestępcy, jego przeszłość ponownie nadchodzi, by go prześladować – ponownie staje twarzą w twarz z potworem, na którym operował. Musi teraz podjąć się podróży w poszukiwaniu sprawiedliwości, aby naprawić szkody wyrządzone przez tego, którego uratował.