Yoshino Takigawa, typowy nastolatek, w tajemnicy spotyka się z Aiką, młodszą siostrą jego najlepszego przyjaciela, Mahiro Fuwy. Jednak po tym, jak Aika ginie w tajemniczych okolicznościach, Mahiro znika, przysięgając, że odnajdzie jej mordercę i zemści się za zabójstwo swojej ukochanej siostry. Yoshino kontynuuje swoje codzienne życie i przez miesiąc nie słyszy od Mahiro – dopóki dziwna dziewczyna nie przykłada mu broni do głowy, a jego najlepszy przyjaciel nie pojawia się akurat na czas, by go uratować. Yoshino odkrywa, że Mahiro zatrudnił wiedźmę o imieniu Hakaze Kusaribe, aby polowała na mordercę Aiki. Jednak Hakaze została wygnana na opuszczoną wyspę z powodu wewnętrznych rozruchów w jej klanie. Jej brat, Samon, egoistycznie dąży do wykorzystania mocy Drzewa Exodusu, ignorując zarówno sprzeciw swojej siostry, jak i nadchodzące zagrożenie dla świata. Gdy Hakaze zostaje zepchnięta na margines, Yoshino i Mahiro muszą teraz pomóc jej uratować świat, jednocześnie zbliżając się do prawdy dotyczącej śmierci Aiki.