Stworzenia ciemności i zła plączą noc, pożerając każdego człowieka, który ma nieszczęście wpąść w ich szpony. Po drugiej stronie stoi Hellsing, organizacja poświęcona niszczeniu tych nadprzyrodzonych sił, które zagrażają samemu istnieniu ludzkości. Na jej czele stoi Integra Fairbrook Wingates Hellsing, która dowodzi potężną armią i spędza całe życie walcząc z nieumarłymi. Jednakże ogromna armia Integry nie ma szans w porównaniu z jej ostateczną bronią: wampirem Alucardem, który działa przeciwko własnej rasie jako eksterminator dla Hellsing. Z nowym wampirzym sługą, Seras Victorią, u boku, Alucard musi walczyć nie tylko z potworami, ale także ze wszystkimi, którzy stoją w opozycji do Hellsing, niezależnie od tego, czy maskują się jako dobro czy zło. W walce o przetrwanie ludzkości Hellsing Ultimate udowadnia, że pozory mylą, a czasem największą bronią może być nasza najgorsza koszmar.