Przez ostatnie trzy lata szkoła średnia Teikou dominowała w krajowych rozgrywkach koszykarskich dzięki swojej legendarniej kadrze: „Pokoleniu Cudów”. Grupa ta składała się z pięciu prodigów, którzy wybitnie radzili sobie w sporcie, jednak „Fantomatyczny Szósty Gracz” działał w cieniu, pomagając utrzymać prestiżowy status drużyny. Ostatecznie ich szybki rozwój sprawił, że stracili entuzjazm do sportu, który kochali, co doprowadziło do ich rozstania w szkole średniej. Szukając nowych członków, drużyna koszykarska szkoły średniej Seirin rekrutuje Taigę Kagamiego i Tetsuyę Kuroko, dwóch nowo przyjętych uczniów, którzy wydają się posiadać zupełnie różne umiejętności. Kagami, który niedawno powrócił z Ameryki, chwali się zarówno naturalnym talentem, jak i nieustępliwą pasją do gry. Z kolei Kuroko nie zwraca na siebie uwagi i nie wykazuje żadnych wybitnych zdolności sportowych. Jednak później okazuje się, że jest on Fantomatycznym Szóstym Graczem z Teikou – graczem, który kiedyś należał do Pokolenia Cudów. Kuroko ma na celu udowodnienie drużynie Seirin, że jest silny na swój własny sposób. Dostrzegając jego determinację, Kagami tworzy z nim dynamiczny duet, a Kuroko obiecuje wspierać „światło” Kagamiego jako jego „cień”. Razem ze swoimi nowymi kolegami z drużyny Seirin dążą do podboju nadchodzącego mistrzostwa Interhigh, choć ponowne pojawienie się byłych kolegów Kuroko komplikuje ich plany.