Szkoła średnia Teikou jest znana ze swojej wybitnej drużyny koszykówki, która dała początek legendarnemu „Pokoleniu Cudów”: grupie pięciu wirtuozów, z których każdy posiadał unikalne talenty i którzy uważani byli za niepokonanych, gdy osiągnęli trzeci rok nauki. Jednakże, przyćmieniowi przez arogancję, rozeszli się w różne strony, uczęszczając do różnych szkół średnich po ukończeniu szkoły średniej. Taiga Kagami, który właśnie wrócił z Ameryki, dołącza do drużyny koszykówki w szkole średniej Seirin, szukając potężnych partnerów. Tam spotyka Tetsuyę Kuroko, gracza, który wydaje się niezwykły, tylko aby odkryć, że Kuroko był „Fantastycznym Szóstym Graczem” Pokolenia Cudów: niewidzialnym graczem, który polegał na swoich doskonałych podaniach, aby wspierać drużynę z boku. Razem obiecują sobie pokonać Pokolenie Cudów i uczynić drużynę koszykówki Seirin najlepszą w Japonii.