Po tym, jak stanął w obronie kobiety przed gwałtem, stawiając czoła potężnemu mężczyźnie, Akira Kurusu kończy z kartoteką kryminalną za zrobienie właściwej rzeczy. Skutki tego zmuszają go do przeprowadzki do Shibuyi i zapisania się do Akademii Shujin po wykluczeniu ze swojej poprzedniej szkoły. Odrzucany przez otoczenie, Akira wielokrotnie słyszy, by trzymał się cicho i przetrwał rok szkolny bez robienia problemów. Niestety, jego przybycie do Shibuyi okazuje się niczym innym jak dziwnym i kłopotliwym. Akira odkrywa na swoim telefonie aplikację, której nie można usunąć, nie wiedząc, kiedy ją pobrał. Podróżując do szkoły, wpada w deszcz wraz z Ryuuji Sakamoto, notorycznym delikwentem z Shujin. Gdy aplikacja na telefonie nagle aktywuje się, zostają przeniesieni do przerażającego świata pełnego demonicznym stworzeń. Gdy okazuje się, że są otoczeni przez te cieniaste istoty, w Akirze budzi się wrodzona moc, pozwalająca mu na walkę z nimi. Teraz wyposażony w „Personę”, manifestację swojej osobowości, Akira łączy siły z Ryuuji, aby rozwikłać tajemnicę tego nieznanego świata.