Dwadzieścia tysięcy lat po upadku ludzkości Ziemia padła łupem hord żarłocznych bestii, które teraz niekontrolowanie błąkają się po planecie. W odległych głębinach kosmosu ostatnie resztki ludzkości błądzą bez celu na pokładzie statku, którym uciekli z Ziemi lata temu. Gdy zasoby statku kosmicznego spadają do krytycznego poziomu, rządziący radzie przetrwających staje przed kluczowym wyborem: kontynuować ryzykowną grę w poszukiwaniu innego, podobnego do Ziemi świata, czy też posłuchać anonimowego eseju, który sugeruje, co może być jedyną słabością "Godzilli", istoty, która wypędziła ostatnich ludzi z ich domu. Autorem eseju jest Haruo Sakaki, mężczyzna, który w młodości był świadkiem śmierci swoich rodziców pod pazurami Godzilli, co zrodziło w nim obsesyjną nienawiść do potwora. Teraz kieruje misją odzyskania dziedzictwa ludzkości od króla potworów i jego trwałego zniszczenia. Jednak wraz z ludzkością Ziemia również uległa drastycznej zmianie od czasu ich wyjazdu; Godzilla i jego liczne potomstwo mogą wydawać się nieznaczne w porównaniu do ciemności, która zagnieździła się w sercach tej zgranej społeczności przetrwających.