Zuru, młoda dziewczyna, wyrusza w ekspedycję przez postapokaliptyczne miasto zdominowane przez maszyny, desperacko szukając jedzenia. Sytuacja staje się krytyczna, gdy jej drużyna przypadkowo aktywuje system obrony sztucznej inteligencji miasta, Safeguard. Gdy maszyny atakują, a jej towarzysze stają w obliczu natychmiastowej zagłady, pojawia się tajemniczy mężczyzna o imieniu Killy i eliminuje wrogie jednostki. Mimo jego heroicznej interwencji, Zuru pozostaje ostrożna wobec Killy i kwestionuje jego intencje. Wyjaśnia, że przybył z tysięcy poziomów poniżej miasta, aby zlokalizować ludzi z Genami Terminala Sieci – cechą, która mogłaby umożliwić ludzkości odzyskanie kontroli nad swoją cywilizacją i dezaktywację Safeguard. Po wysłuchaniu jego relacji, Zuru i jej drużyna dołączają do Killy, wyruszając w podróż w poszukiwaniu Genów, które mogą stanowić ostatnią szansę ludzkości na przetrwanie.