Dziesięć lat po wydarzeniach z xxxHOLiC Shunmuki, melancholijny Kimihiro Watanuki przejął sklep, który dawniej prowadziła tajemnicza Yuuko, wypełniając obietnicę, którą jej złożył. Jego towarzysze Maru, Moro i Mokona żyją z nim w względnej zadowoleniu, a od czasu do czasu zaglądają do niego znane twarze: były rywal, który stał się niezłomnym przyjacielem, Shizuka Doumeki, oraz byłej psychicznej cudowne dziecko Kohane Tsuyuri. Podczas gdy Kohane studiuje folklor pod kierunkiem Doumeki na uniwersytecie, napotykają sprawę, która jest idealna dla mistrza sklepu. Ostatecznie Watanuki otrzymuje wizytę od dziadka Doumeki, Haruki. Prosi on Watanuki, aby zbadał sny swojego wnuka. Wewnątrz świata snów odkrywa, jak ich przeszłe przygody rozegrały się z punktu widzenia Doumeki, co prowadzi Watanuki do odkrycia prawd sprzed 10 lat i tajemnic dotyczących więzi, które łączą ich przyjaźń.