Po śmierci rodziców Kimihiro Watanuki mieszka sam. Jest uczniem liceum, który potrafi widzieć istoty z innego świata, przyciągane do niego. Te uciążliwe stworzenia dręczą go na co dzień, a on pragnęłby pozbyć się tego kłopotu. Pewnego przeznaczonego dnia, uciekając przed hordą duchów, Kimihiro wpada do tajemniczego sklepu, szukając schronienia. Tam spotyka Yuuko Ichiharę, właścicielkę tego rzekomego sklepu, która twierdzi, że potrafi spełniać życzenia. Yuuko proponuje spełnienie życzenia Kimihiro, pod warunkiem zapłacenia odpowiedniej ceny. Tak zaczyna się praca Kimihiro w jej sklepie, aby zarobić kwotę potrzebną do spełnienia jego życzenia. Pracując dla Yuuko, musi jeszcze bardziej zaangażować się w sprawy duchów i nadprzyrodzonych zjawisk, zanim będzie mógł odejść od tego świata. Jak poradzi sobie w nie do wyjaśnienia spotkaniach, które go czekają?