Po śmierci rodziców Shinpei Ajiro mieszkał z rodziną Kofune i ich dwiema córkami, Mio i Ushio. Choć później opuścił swoją wyspę, aby kontynuować naukę w Tokio, Shinpei wraca po tragicznym utonięciu Ushio, która próbowała uratować młodą dziewczynkę. Na pogrzebie jego najlepszy przyjaciel ujawnia siniaki wokół szyi Ushio, co budzi wątpliwości co do przyczyny jej śmierci. Podejrzewając morderstwo, Shinpei ponownie analizuje ostatnie wydarzenia, ale dziwne incydenty nadal się pojawiają. Zniknięcia i inne niewytłumaczalne zjawiska skłaniają Mio do przypomnienia sobie starej baśni o istotach zwanych "Cieniami", które mogą nie być całkowicie fikcyjne. Mówi się, że spotkanie ze swoim Cieniem zapowiada nadchodzącą śmierć danej osoby. Stając twarzą w twarz z mroczną stroną wyspy Hitogashima, Shinpei walczy ze swoim ponurym losem, aby spełnić ostatnią wolę Ushio: ochronić Mio.