W nowej, kapryśnej erze Battle Spirits karty rozproszyły się po kolorowej galaktyce, kusząc wszystkich "poszukiwaczy kart", by stali się rywalami w poszukiwaniu najsilniejszych kart. Rei to wyzywający wędrowiec, obsesyjnie dążący do bycia na szczycie. Towarzyszą mu mały smok o imieniu Mugen i gadający robot o imieniu Salt, a samoproklamowany "Numer Jeden Gwiazdy" regularnie angażuje się w karciane wybryki poprzez błyszczące bitwy. Pewnego dnia Rei spotyka Rairę i Rikuto April, z których obaj wydają się posiadać wskazówki dotyczące miejsca pobytu "ostatecznej" karty Battle Spirits. Razem wyruszają w podróż, aby znaleźć tę kartę, zderzając się w drodze z wieloma barwnymi osobowościami. Wkrótce ich przygoda zwraca uwagę Gildii, chytrych złoczyńców, którzy również dążą do zdobycia Ostatecznego Battle Spirits. Rywalizując z Gildią, status Rei jako numer jeden zostaje poddany próbie – przedsięwzięcie, które powoli ujawni sekrety dotyczące losów wszechświata.