Toppa Bashin, pełen energii i szukający emocji szósty klasista, skupia się na jednej rzeczy: grze karcianej Battle Spirits. Nosząc rubinowy wisierek po swoim zaginionym ojcu, Bashin codziennie z niecierpliwością idzie do szkoły – nie dla nauki, ale dla walk kartami, co bardzo denerwuje jego rówieśników. Pewnego dnia Bashin spotyka J, dziecięcego geniusza i mistrza Battle Spirits, który nosi podobny wisierek. Fascynowany, Bashin wyzwa J do walki. Jednak walka, w którą się angażują, nie jest taka, jak się spodziewał; zostają przeniesieni do tajemniczej arenie w niebie – Świata Isekai – gdzie duchy z gry stają się realne. Wyczuwając, że jego marzenie jest wreszcie na wyciągnięcie ręki, Bashin z entuzjazmem wrzuca się w Świat Isekai, spotykając innych graczy w karty z niezwykłymi wisiorkami. W miarę jak wspina się na szczyt, stopniowo uświadamia sobie, że Battle Spirits to coś więcej, niż kiedykolwiek sobie wyobrażał.