Shiki Toono budzi się na oddziale szpitalnym, posiadając zdolność widzenia niewidzialnych linii. Te cienkie nici, które stanowią całą materię w Shingetsutan, natychmiast niszczą obiekt, gdy zostaną przecięte. Shiki odkrywa, że śledzenie linii obiektu prowadzi do jego natychmiastowego zniszczenia. Ukrywając swoją nadprzyrodzoną wizję, Shiki próbuje spokojnie przeżyć drugi rok liceum. Jednak ten spokój jest krótkotrwały; wracając ze szkoły, Shiki napotyka tajemniczą kobietę o jasnoczerwonych oczach. Po nagłym ataku szaleństwa, wydaje się, że zabija kobietę i wkrótce potem upada. Jakby sprawy nie mogły być gorsze, następnego dnia Shiki jest atakowany przez parę demoniczych psów. Stojąc w obliczu pewnej śmierci, Shiki zostaje uratowany przez timely przybycie tej samej kobiety z poprzedniego dnia. Przedstawia się jako Arcueid Brunestud, wampirza księżniczka. Decydując się na współpracę, Shiki i Arcueid wyruszają w podróż, aby odkryć prawdę dotyczącą ich pochodzenia i niedawnej serii morderstw w mieście.