Punpun Onodera to zwyczajny 11-letni chłopiec mieszkający w Japonii. Skrajnie idealistyczny i romantyczny, Punpun zaczyna dostrzegać, jak jego życie subtelnie — choć równocześnie zaskakująco — skręca w stronę dorosłości, gdy poznaje nową dziewczynę w swojej klasie, Aiko Tanakę. Wtedy to cichy chłopiec dowiaduje się, jak kapryśne może być utrzymywanie relacji oraz jak wielkie są trudności związane z przejściem od naiwnego chłopięctwa do skomplikowanej dorosłości. Gdy pewnej nocy jego ojciec atakuje matkę, Punpun uświadamia sobie jeszcze jedną rzecz: ci, do których podziwiał, nie byli tak imponujący, jak kiedyś sądził. Gdy jego problemy się nasilają, niegdyś nieśmiały wygląd Punpuna zamienia się w dobrowolne wycofanie. Zamiast wyleczyć go z problemów i sprzecznych emocji, jedynie je nasila, popychając go na ciemną ścieżkę dojrzewania w tej mrocznej opowieści o dorastaniu.