Susumu Nakoshi to mężczyzna w średnim wieku, który dzieli swój czas między luksusowy hotel pierwszej klasy a park zamieszkany przez bezdomnych. Pewnego dnia do Nakoshiego podchodzi ekscentryczny młody człowiek, szukający osób skłonnych do poddania się trepanacji – zabiegowi polegającemu na wierceniu otworu w czaszce. Ten tajemniczy osobnik twierdzi, że Nakoshi jest idealnym kandydatem do eksperymentu. Choć początkowo odrzuca propozycję, zmienia zdanie po tym, jak jego samochód zostaje odholowany. Nakoshi zgadza się pozwolić Manabu Ito, 22-letniemu studentowi medycyny, na wiercenie otworu w jego czaszce w zamian za 700 000 jenów. Zabieg początkowo nie przynosi żadnych rezultatów, a Nakoshi nie wykazuje żadnych nieprawidłowości. Jednak ta normalność nagle się kończy, gdy Nakoshi zaczyna widzieć homunkulusów w każdej osobie. Z zniekształconym postrzeganiem, jak Nakoshi zmierzy się z tymi homunkulusami?