Siedemnastoletni Jirou Azuma prowadzi spokojne życie ze swoim dziadkiem, używając swojej nadprzyrodzonej zdolności do komunikowania się z zwierzętami, aby je zaprzyjaźniać i chronić. Zarówno Jirou, jak i jego dziadek są potomkami starego rodu shinobich, trenując w walce, aby zachować rodzinną sztukę walki. Życie Jirou wpada w chaos, gdy ratuje pozornie zwyczajnego czarnego kota o imieniu Ragou, by odkryć, że kot jest w rzeczywistości mononoke — demonicznym duchem, który od dawna toczy wojnę z ludzkością. Gdy wrogi mononoke przychodzi po Ragou, Jirou używa swojego treningu shinobich, aby obronić kota, ale natychmiast odnosi śmiertelne rany. Stojąc przed wyborem pożerania słabnącej energii Jirou, aby odzyskać swoją pełną moc, Ragou zamiast tego decyduje się przekazać swoją pozostałą energię Jirou. Ten transfer ożywia chłopca i nadaje mu wielką nadprzyrodzoną moc, która uzupełnia jego styl walki shinobich. Ten akt obserwuje Ryousuke Shiba, oficer Biura Szpiegostwa, którego zadaniem jest wysyłanie agresywnych mononoke. Shiba składa Jirou i jego dziadkowi propozycję: dołączenia do nowej drużyny Biura, Black Torch, i pomocy im w walce z potężnymi mononoke, które chcą pożerać niewinnych ludzi.