W mgnieniu oka nocne niebo zostaje trwale zmienione, gdy potężna eksplozja rozrywa Księżyc, zamieniając go w wieczny sierp. Żółty potwór z mackami konfrontuje się z rządami świata, chwaląc się, że to on spowodował tę katastrofę i zrobi to samo z Ziemią w ciągu roku. Poruszając się z prędkością Macha 20, stworzenie wysuwa dziwne żądanie: stanowisko nauczyciela w prestiżowej szkole średniej Kunugigaoka. Rząd, desperacko chcąc utrzymać potwora w jednym miejscu, zgadza się, pozostawiając uczniom klasy 3-E niemożliwe zadanie – zamordować stworzenie odpowiedzialne za zniszczenie Księżyca. Mimo że los świata spoczywa teraz na ich barkach, klasa ma do rozwiązania więcej osobistych problemów. Uwięzieni na samym dnie hierarchicznego systemu edukacyjnego Kunugigaoki, mierzą się z surową dyskryminacją ze strony zarówno nauczycieli, jak i uczniów. Panuje wśród nich pesymizm; nie wierzą, że są w stanie odnieść sukces w codziennym życiu, a tym bardziej przeciwko potworowi, który przewyższa zdolności każdego człowieka. Jednak gdy tajemnicze stworzenie – które nazywają Koro-sensei – uczy ich zarówno sztuki zabijania, jak i przedmiotów akademickich, dzieci powoli znajdują odwagę, by podnieść się i celować w swój cel: największego nauczyciela, jakiego świat kiedykolwiek widział.