Pół wieku temu Ziemię uratował pozaziemski gigant światła o imieniu Ultraman, lecz zniknął. Ludzki żywiciel Ultramana, Shin Hayata, stracił wspomnienia z czasów, gdy był bohaterem. Okazuje się, że jego młody syn, Shinjirou, urodził się z ciałem potężniejszym i bardziej odpornym niż ciała zwykłych ludzi. Organizacja wspierająca Ultramana, SSSP, ujawnia Hayacie jego przeszłość. Jego ojciec ponownie zakłada kombinezon mocy, ponownie przyjmując rolę Ultramana. Jednej nocy Shinjirou zostaje zaatakowany przez obcego o imieniu Bemular i uratowany przez ojca, który w walce ciężko się rani. Gdy w mieście czai się niebezpiecznych obcych, a Hayata jest niezdolny do działania, to na Shinjirou spada odpowiedzialność za przejęcie sztafety. Jednak współpracując z SSSP jako nowy Ultraman, Shinjirou zaczyna zastanawiać się, jak daleko jest gotów zajść, aby pomóc ludziom.