Soul Translator to zaawansowany interfejs pełnego zanurzenia, który oddziałuje na Fluctlight użytkownika – technologiczny odpowiednik ludzkiej duszy – i różni się fundamentalnie od ortodoksyjnej metody wysyłania sygnałów do mózgu. Prywatny instytut Rath dąży do udoskonalenia swojego wynalazku, angażując do współpracy Kazuto Kirigayę, przetrwałego Sword Art Online. Pracuje tam jako pracownik etatowy, testując możliwości systemu w Underworldzie: fantastycznym świecie generowanym przez Soul Translator. Zgodnie z umową o poufności, wszelkie wspomnienia utworzone przez maszynę w świecie wirtualnym są usuwane po powrocie do świata rzeczywistego. Kazuto może jedynie mgliście przypomnieć sobie jedno imię, Alice, co wywołuje u niego poczucie niepokoju, gdy jest ono wspominane w rzeczywistości. Gdy pewnego wieczoru Kazuto odprowadza Asunę Yuuki do domu, napotykają znajomego wroga. W trakcie walki Kazuto zostaje śmiertelnie ranny i traci przytomność. Gdy odzyskuje świadomość, odkrywa, że dokonał pełnego zanurzenia w Underworldzie, nie widząc pozornie żadnej drogi ucieczki. Wyprawia się w podróż, szukając sposobu na powrót do świata fizycznego.