Dla licealistów, takich jak Shouichi Kamita, egzaminy maturalne i przyszłość to typowe zmartwienia. To również etap życia, w którym tajemnicze uczucie, dręczące ludzi wszystkich wieków, może zacząć zajmować myśli – miłość. W tym okresie swojej adolescencji Shouichi spotyka trzy dziewczyny, z którymi potrafi wyobrazić sobie przyszłość: wiecznie wesołą Hikari Tsuneki, która bezlitośnie drwi z Shouichiego, ale w rzeczywistości posiada łagodniejszą stronę; rywalizującą graczkę Tooru Miyamae, która ma trudności z komunikacją z innymi; oraz przyjaciółkę z dzieciństwa Shouichiego, Kyouko Touno, okazjonalnie niedojrzałą fankę shoujo manga. Seiren śledzi relacje Shouichiego z tymi trzema dziewczynami przez trzy odrębne arki, podczas gdy ich uczucia ewoluują od wzajemnego zainteresowania i rozkwitają w coś piękniejszego.