Rok 1983. Wojna Zimna trwa w najlepsze, a ludzkość staje w obliczu ataku. Dziwne obce istoty, nazwane „BETA”, zstąpiły na Ziemię z zamiarem unicestwienia całego życia. Żołnierze mają za zadanie pilotować duże kombinezony bojowe znane jako Taktyczne Walczące Maszyny Powierzchniowe (TSF), aby odparć obcych inwazjonistów, jednak front jest stopniowo wypychany w kierunku przetrwałych miast. Schwarzesmarken śledzi losy porucznika Theodora Eberbacha i pozostałych członków 666. eskadry TSF, bezlitosnej jednostki, która stawia wykonanie misji wyżej niż ludzkie życie. Rozlokowana w NRD i dowodzona przez bohaterkę wojenną kapitana Irisdinę Bernhard, jednostka specjalizuje się w kontratakach przeciwko BETA klasy laserowej. Jednak 666. eskadra napotyka więcej wrogów niż tylko siły obcych, gdy do jednostki dołącza optymistyczna nowicjuszka Katia Waldheim, przyciągając uwagę tajnej policji NRD, Stasi.