Podczas wydarzeń oryginalnej serii Rozen Maiden, po zaznaczeniu „tak” na kartce i zgodzie na nawinięcie nieznanego „czegoś”, zraniony Jun Sakurada walczy obok realistycznych lalek znanych jako Rozen Maidens. Ale co by się stało, gdyby Jun zaznaczył „nie”? Jun, który pokonał swoje szkolne traumy z młodszych lat, spędza czas na studiach i pracy w księgarni. Jednak nie czuje, że należy do jakiegokolwiek miejsca. Pewnego dnia znajduje książkę zawierającą instrukcje, jak stworzyć Rozen Maidena. Tajemniczo, gdy wraca tego wieczoru do domu, druga część serii książek zostaje dostarczona do jego domu wraz z kilkoma częściami lalki. Ale tak nagle, jak zaczęły przybywać, książki przestają przychodzić, a Jun otrzymuje powiadomienie, że książki przestały być publikowane. Trzymając w ręku niedokończoną lalkę i otrzymawszy wiadomość od swojego drugiego ja z innego świata, ten Jun również znajduje drogę do świata Rozen Maidens.