W Królestwie Windbloom Arika Yumemiya zapisuje się do Akademii Garderobe, aby zostać Otome — panną młodą zdolną do władania HiME (Highly-advanced Materializing Equipment), która nadaje destrukcyjne moce. Arika liczy również na odnalezienie swojej matki, która była Meister Otome, najwyższym rangą Otome, pełniącą funkcję osobistej ochrony i superbroni dla konkretnego narodu, któremu została przydzielona. Podczas pobytu w akademii Arika zaprzyjaźnia się z Niną Wáng, wybitną studentką Otome, oraz Mashiro Blan de Windbloom, obecną księżniczką królestwa. Dzięki ich wsparciu Arika szybko dostosowuje się do atmosfery akademii, spędzając dni na pilnym treningu, zarządzaniu relacjami społecznymi i doskonaleniu swoich umiejętności jako Otome. Jednak Arika wkrótce odkrywa, że droga do zostania Otome jest pełna niebezpieczeństw i wątpliwych manewrów politycznych. Stojąc w obliczu licznych osobistych dylematów, Arika musi dokonać znaczących poświęceń, jeśli chce naprawdę osiągnąć swoje cele.