Po trzech latach wspólnego życia związek Misaki Takahashi i Akihiko „Usagi” Usami rozwija się bezproblemowo. Jednak każdy wielki związek ma swoje problemy, a ich właśnie się zaczynają. Z nowym rywalem na horyzoncie Usagi martwi się o uczucia Misaki do niego. Tymczasem Ryuuichirou Isaka zawsze uwielbiał wtrącać się w miłosne życie Misaki i Usagi, ale jego własne życie uczuciowe nie było już tak gładkie – Isaka i jego sekretarka Kaoru Asahina spotykają się od kilku lat; jednak Asahina woli oddzielić swoje życie zawodowe od prywatnego, co często prowadzi do trudnych sytuacji między nimi. Co do Nowaki Kusamy i Hiroki Kamijou, teraz, gdy ich kariery w końcu zaczynają się rozwijać, ledwo się widują. Wraz ze zmniejszaniem się czasu spędzanego razem, wątpliwości i niepewności grożą, że się w nich pojawią. Z drugiej strony, 17-letnia różnica wieku między Shinobu Takatsuki a You Miyagi była stałą barierą w ich związku, ale wraz z poznawaniem się nawzajem, ich nieśmiałość nadal zanika. Ulubione pary z Junjou Romantica, Junjou Egoist i Junjou Terrorist wracają ponownie, tym razem z nowym dodatkiem: Junjou Mistake!