W obliczu nadchodzącej II wojny światowej informacje wywiadowcze dotyczące warunków społecznych i gospodarczych innych krajów stały się cennym atutem. W związku z tym Japonia utworzyła nową organizację wywiadowczą o nazwie „Agencja D”, aby uzyskać tę przewagę. Pod dowództwem podpułkownika Yuukiego ośmiu agentów zostało wysłanych, aby infiltrować i obserwować niektóre z najpotężniejszych krajów świata, raportując o wszelkich wydarzeniach związanych z wojną. Aby wykonać te niebezpieczne misje, ci mężczyźni przygotowali swoje ciała do przetrwania w ekstremalnych warunkach i studiowali różne dziedziny, w tym komunikację i języki. Jednak ich największą siłą jest zdolność do manipulowania ludźmi w celu uzyskania informacji niezbędnych do zapewnienia ich narodowi przewagi.