Po śmierci Saizou, strasznie surowego dziadka Kabamaru i instruktora (sensei) ninja z Iga, starsza kobieta o imieniu Ran Ookubo twierdzi, że otrzymała od niego list z prośbą o opiekę nad jego wnukiem. W związku z tym Kabamaru udaje się z Lady Ookubo do dużego miasta, Tokio, aby delektować się yakisoba, ramenem i chow mein oraz zapisać się do zwykłej szkoły, która okazuje się mieć swoje własne dziwactwa.