Alchemicy to osoby o szerokich wiedzy i naturalnym talencie, które potrafią manipulować i modyfikować materię za pomocą swojej sztuki. Mimo ogromnego zakresu możliwości, alchemia nie jest tak wszechmocna, jak większość ludzi sądzi. Transmutacja ludzka jest surowo zabroniona, a każdy, kto spróbuje jej dokonać, ryzykuje poważne konsekwencje. Mimo to rodzeństwo Edward i Alphonse Elric postanawia zignorować to wielkie tabu i przywrócić matce życie. Niestety, nie tylko nie udaje im się wskrzesić jej, ale także płacą bardzo wysoką cenę za swoją arogancję: Edward traci lewą nogę, a Alphonse całe ciało. Co więcej, Edward poświęca również prawą rękę, aby zamknąć duszę brata w pancerzu. Kilka lat później młodzi alchemicy podróżują po kraju w poszukiwaniu Kamienia Filozoficznego, licząc, że dzięki jego mocy odzyskają swoje dawne ciała. Jednak ich poszukiwania skazanego na klęską kamienia prowadzą ich również do odkrycia znacznie mroczniejszych tajemnic, niż kiedykolwiek mogli sobie wyobrazić.