W jedenastym roku ery Meiji upadek shogunatu samurajów i zakaz noszenia mieczy pozostawiły trwałe ślady w Japonii. Niezadowoleni z tych ostatnich zmian, wielu byłych samurajów spiskuje przeciwko nowemu rządowi, co wywołuje falę krwawych rozliczeń. Aby przeciwstawić się temu ruchowi, rząd buduje gigantyczną więzienie w środku jeziora Biwa. Nieoficjalnie powołany do pomocy policji w aresztowaniu przestępców, Tenka Kumou pracuje również jako łodziej do więzienia na jeziorze Biwa, wspierany przez swoich dwóch młodszych rodzeństwa: ambicyjnego Soramaru i entuzjastycznego Chuutarou. Razem z byłym ninją z klanu Fuma, Shirasu Kinjou, bracia Kumou prowadzą skromne i radosne życie, poświęcone głównie nauce i treningowi. Jednakże pod tą pozornie spokojną codziennością, cień przekleństwa „Orochi” zaczyna rzucać swój cień nad miastem Oumi. Legenda głosi, że co trzy sto lat Orochi wciela się w ludzkie ciało – a wierzy się, że to sygnał nadchodzącej katastrofy. Gdy różne grupy zderzają się w poszukiwaniu naczynia Orochi, niektóre dążą do zamknięcia przekleństwa, podczas gdy inne realizują ciemniejsze plany.