Captain Tsubasa opowiada pasjonującą historię ucznia szkoły podstawowej, którego myśli i marzenia krążą niemal wyłącznie wokół jego miłości do piłki nożnej. Jedenastoletni Tsubasa Oozora zaczął grać w piłkę w bardzo młodym wieku; podczas gdy dla jego przyjaciół był to głównie sport rekreacyjny, dla niego stał się czymś w rodzaju obsesji. Aby realizować swoje marzenie na najwyższym poziomie swoich możliwości w szkole podstawowej, Tsubasa przeprowadza się z matką do miasta Nankatsu, znanego z doskonałych szkolnych drużyn piłkarskich. Jednak mimo że był niekwestionowanym najlepszym w swoim dawnym mieście, w Nankatsu konkurencja jest znacznie większa, a aby wyróżnić się w tym nowym gronie, będzie potrzebował wszystkich swoich umiejętności i talentu. Spotyka nie tylko rywali, ale także nowych przyjaciół, takich jak ładna dziewczyna Sanae Nakazawa oraz utalentowany bramkarz Genzo Wakabayashi, który dzieli tę samą pasję co Tsubasa i okaże się cennym przyjacielem, pomagając mu dążyć do swoich marzeń. Reprezentacja Japonii w Pucharze Świata FIFA to ostateczne marzenie Tsubasy, ale do jego realizacji potrzebne będzie znacznie więcej niż sam talent.