Ryoji Minagawa i Kyoichi Nanatsuki przedstawiają świat, w którym występują nanomaszyny, cybernetyczni zabójcy, potężni przeciwnicy z telekinezą oraz tajna organizacja dążąca do wprowadzenia kolejnego etapu ewolucji człowieka. Łącząc najlepsze elementy science-fiction, thrillerów szpiegowskich i narracji spiskowych, Project Arms koncentruje się na dzieciach, których kończyny przekształcają się w okaleczone, potworne superbroń.