Sho i jego przyjaciel, Tetsuro, znajdują w lesie dziwny, kulisty urządzenie – Jednostkę Guyvera. Połączy się ono z ciałem Sho, zamieniając go w obcego wojownika, Guyvera. Jego zadaniem jest ochrona Jednostki Guyvera przed Chronos, japońską korporacją, która poluje na nią oraz dwie inne identyczne jednostki. Aby odzyskać obiekt, Chronos wysyła okrutne potwory zwane Zoanoidami. W rezultacie nikt z otoczenia Sho nie jest bezpieczny – nawet on sam.