Druga część opowiada o Ryo Takatsuki i jego towarzyszach, którzy starają się rozwikłać tajemnicę dotyczącą A.R.M.S., z których wszyscy korzystają, oraz przewidzieć, co przyniesie im przyszłość. Wiadomo już, gdzie znajdują się odpowiedzi, ale ich uzyskanie wymaga rozpaczliwej walki o przetrwanie przeciwko potężnej korporacji wojskowej, która nie cofnie się przed niczym, by zagarnąć ich sekrety.