Mimo że wychowywał się jako sierota, Nio Chirinu znajduje poczucie przynależności, pracując jako kelner w restauracji swojej przybranej babci. Jednak ten spokój jest krótkotrwały; Nio i jego siostra Iroha zostają wykorzystani jako przynęta przez Toshizou Hijikatę i Soujiego Okitę – dwóch członków notorycznej grupy roninów znanej jako Miburo – w celu schwytania porywaczy dzieci. Po tym incydencie Toshizou zaprasza Nio do dołączenia do Miburo i ochrony mieszkańców Kioto. Zdemoralizowany własną brakiem siły, Nio trenuje, aby nadążyć za sztuką miecza swoich nowych towarzyszy. Mimo to ma trudności z zyskaniem akceptacji Tarou Tanaki i Hajime Saitou, innych członków Miburo w jego wieku. Rozwiązany na zaprzyjaźnienie się z nimi, Nio musi odkryć własne poczucie sprawiedliwości i stać się na tyle silny, aby pokonać wszystkich swoich przeciwników.