Od czasu, gdy Yuugi pokonał Maxmilion Pegasus, superbogatego projektanta gry karcianej „Duel Monsters”, minęło wiele pojedynków. Jednak Yako Tenma, podopieczny Pegasus, nigdy nie wybaczył Yuugi za okropny los, jaki spotkał jego mistrza. Aby wabić Yuugi, Yako porwał Anzu Mazaki i przeniósł ją do serca budynku Kaibacorp, strzeżonego przez dziesiątki najbardziej niebezpiecznych graczy na świecie! Ale prawdziwy plan Yako wobec Anzu jest znacznie gorszy niż zwykła zemsta...