Akcja Wonderful Days rozgrywa się w roku 2142 i przedstawia świat niemal zniszczony przez zanieczyszczenie środowiska. Ludzkie życie, jakie znamy, jest praktycznie wymarłe, przetrwali tylko nieliczni po upadku ekosystemu Ziemi. Aby zarządzać chaosem, założono miasto o nazwie Ecoban. To miasto wykorzystuje samo zanieczyszczenie, które spowodowało katastrofę, jako źródło energii. Jednak, choć początkowy plan odniósł pewien sukces, nie stworzył on jedynie nowego źródła energii, ale także elitarną grupę ludzi. Ta prestiżowa frakcja uważa się za wyższą od systemu i odmawia przyjmowania przetrwałych spoza miasta, chyba że zostaną oni zatrudnieni jako robotnicy. Spośród osób żyjących na pustkowiu poza Ecoban znajduje się młody człowiek o imieniu Shua. Prowadzi bardzo trudne życie, ale próbuje czerpać z niego jak najwięcej dzięki miłości, którą czuje do swojej przyjaciółki z dzieciństwa, Jay. Niestety, Jay może być bardziej zainteresowana swoim dowódcą ochrony, Cade, niż Shuą, co tworzy trójkąt miłosny. Shua musi nie tylko poradzić sobie z rozczarowaniem miłosnym, ale także znaleźć nowy sposób na przetrwanie w ruinach niegdyś pięknej planety Ziemia.