W roku 2205 specjalny mędrzec znany jako Saniwa posiada zdolność nadawania życia przedmiotom nieożywionym. Jednocześnie ciemne siły wszczepiają spisek, aby cofnąć się w czasie i zmienić bieg historii – a jedynymi, którzy mogą im przeszkodzić, są Saniwa i ich najpotężniejsze animacje: historyczne japońskie miecze, pojawiające się jako przystojni młodzi mężczyźni. Touken Ranbu: Hanamaru zaczyna się od życia Yamatonokami Yasusada, ukochanej uchigatany Souji Okity, gdy rozpoczyna swój pierwszy dzień w cytadeli Saniwy. Po rychłym ponownym spotkaniu ze swoim starym przyjacielem, Kashuu Kiyomitsu, obaj angażują się w codzienne wybryki swoich towarzyszy-mieczników. Nigdy nie przegapują okazji do zabawy, czy to poprzez dzikie bitwy na śnieżki, czy wprowadzanie swoich najnowszych towarzyszy do cytadeli. Naturalnie, gdy rząd woła, miecze są zawsze gotowe do wypełnienia swojej misji ochrony historii.