W Mieście Akademii, gdzie zdolności nadprzyrodzone są zintegrowane z codzienną nauką, spokój miasta jest utrzymywany przez niewidzialną siłę — ciemną stronę. Wśród tajnych agentów znajduje się ITEM, czterosośna elitarna jednostka. Wykorzystując umiejętności śledcze Rikou Takitsubo, ekspertyzę Frendy Seivelun w zakresie wybuchówek, nieprzeniknioną obronę Saiai Kinuhata oraz przytłaczającą moc Shizuri Mugino jako jednej z siedmiu esperów poziomu 5 w Mieście Akademii, działają w podziemiu miasta, wykonując tajne misje, które nigdy nie trafiają do nagłówków. Gdy ich najnowsze zadanie się rozgrywa, drużyna działa z precyzją, nieświadoma, że ich działania przygotowują grunt pod tragedię, która przetestuje ich więzy zaufania, przyjaźni i przetrwania w nieubłaganym ciemności Miejsca Akademii.