Na początku XXI wieku Ziemia staje w obliczu zagrożenia ze strony gigantycznych komet. W odpowiedzi Organizacja Narodów Zjednoczonych tworzy Agencję Zarządzania Kryzysami Kosmicznymi (CEMA) i wdraża dwuetapowy program obronny. Statki kosmiczne startują z orbitalnych stacji, odpalając specjalistyczne pociski, które przechwytują i rozdrabniają groźne obiekty niebieskie, podczas gdy myśliwce na Ziemi zajmują się pozostałymi fragmentami. Rywalizacja między pilotami jest zacięta, ponieważ wszyscy dążą do tego, by zostać jednym z cenionych Comet Blastersów w kosmosie, a nie Meteor Sweeperem na bazach lotniczych. Mimo że pochodzi z szanowanej rodziny pilotów, rekrutka Mikaze Honjou uważa drogę do zostania Comet Blasterem za trudną, co prowadzi ją do zaniedbywania nauki. Jednak po udanej misji ze swoimi przyjaciółmi – Karin Kikuhara, Shizuha Doi i Ayamo Nakamura – Mikaze odzyskuje motywację i postanawia ukończyć szkolenie wraz z pozostałymi.