"Pomóżmy sobie nawzajem i dążmy do tego, by stać się idealnymi, zwykłymi obywatelami." Po tym, jak przeżył gorzką przygodę w trakcie działań dedukcyjnych znanych jako "praca mądrościowa", Kobato postanawia stać się uczciwym i pokornym obywatelem. W tajemnicy nawiązuje wzajemne relacje ze swoim klasowym kolegą Osanaiem, który podziela tę samą aspirację, planując rozpocząć swoje licealne lata jako zwykli obywatele i prowadzić spokojne życie. Jednak z jakiegoś powodu tajemnicze incydenty i nieszczęścia wciąż napływają jedno po drugim do ich szkolnego życia. Czy Kobato i Osanai będą mogli osiągnąć spokojne życie jako zwykli obywatele?