W prestiżowej Akademii Hanzo wybrana grupa uczniów trenuje w tajemnicy, aby zostać ninja elitarnego klanu zwanego Shinobi Masters. Podążając śladem swojego dziadka, aspirująca Asuka przechodzi ten rygorystyczny trening wraz ze swoim wyjątkowym gronem przyjaciół: Ikarugą, Katsuragi, Yagyuu i Hibari. Starannie studiując tajne sztuki ninja, doskonalą swoje umiejętności w nadziei, że w końcu staną się w pełni rozwiniętymi żeńskimi ninja. Senran Kagura towarzyszy dziewczynom, gdy dzielnie walczą z tajemniczym nowym złem, które straszy Akademię Hanzo. Ubrane w obcisłe ubrania, muszą udowodnić swoją wartość i chronić akademię przed jej przeciwnikami, zanim będzie za późno!