Zmęczona wiejskim wychowaniem, świeżo upieczona absolwentka uczelni Yoshino Koharu pragnie prowadzić bardziej ekscytujące życie w Tokio. Po nieudanym poszukiwaniu pracy otrzymuje wreszcie ofertę pracy dorywczej jako królowa specyficznego „Królestwa Chupakabura”, zaniedbanego mini-atrakcji w małym rolniczym miasteczku Manoyama. Jednak po przybyciu do Manoyamy Yoshino odkrywa, że została pomylona z gwiazdą, a oferta pracy była błędem. Nie mając innych opcji, Yoshino niechętnie zgadza się objąć tę rolę i pomóc Radzie Turystyki w wysiłkach na rzecz rewitalizacji Manoyamy. Zdecydowana na wprowadzenie ekscytacji do upadającego miasteczka przy pomocy lokalnych mieszkańców, królowa wdraża szereg projektów mających na celu podkreślenie piękna i uroku kultury Manoyamy. Sakura Quest przybliża historię spójnej społeczności walczącej o zachowanie równowagi między zmianą a utrzymaniem bogatych tradycji i więzi, które definiują jej tożsamość.