W najbliższej przyszłości Ziemia jest atakowana przez potężne wrogie istoty znane jako „Fiarem”. Aby chronić planetę przed tym obcym zagrożeniem, Japonia wysyła specjalną jednostkę o nazwie „Ragna Strikers”, składającą się z sześciu młodych kobiet wyposażonych w zaawansowaną broń i zdolność do wzrostu do gigantycznych rozmiarów. Ragnastrike Angels śledzi Ayano Anemori i jej towarzyszy, gdy radzą sobie ze swoim codziennym życiem, jednocześnie walcząc z gwałtownymi Fiarem.