W spokojny dzień niebo pęka, a pozazwykłowe istoty znane jako Nieznane rozpoczynają szybki i brutalny atak na ludzkość. Aby zabezpieczyć przyszłość narodu, wszystkie dzieci w Japonii są zamrożone w stanie kriogenicznym do końca wojny, chroniąc je przed krzywdą. Lata później ludzkość zdobywa przyczółek w zakątku Japonii, który staje się teraz frontem wojny. Ponieważ zagłada nie jest już bezpośrednim zagrożeniem, dzieci budzą się ze swojego snu. Okazuje się wtedy, że podczas kriogenezy rozwinęły one Światy – nadprzyrodzone moce unikalne dla każdej jednostki. Sześcioro najpotężniejszych dzieci otrzymuje dowództwo nad odzyskanymi miastami, używając swoich zdolności do obrony twierdz przed trwającą inwazją. Przyjaciele z dzieciństwa Ichiya Suzaku i Canaria Utara dowodzą Tokio, rodzeństwo Kasumi i Asuha Chigusa zarządza Chibą, a Maihime Tenkawa i Hotaru Rindou nadzorują Kanagawę. Z biegiem czasu niemal rutynowe ataki Nieznanych oraz kłócące się osobowości przywódców i zastępców miast rodzą drobne rywalizacje, co prowadzi do ciągłych kłótni między trzema miastami. Gdy Nieznane nagle nasilają swój atak, przywódcy trzech miast muszą nauczyć się współpracy, aby nie stracić ostatniej linii obrony ludzkości przed zagładą.