Cadis Etrama di Raizel, "Noblesse" znany również jako "Rai", zostaje zapisany do szkoły średniej Ye Ran przez swojego sługę Frankensteina, aby pozostać ukryty przed Unią, tajemniczą organizacją pragnącą zabić Raira. Rai zaczyna swoje życie jako uczeń, poznając swoich kolegów z klasy i codzienne rutyny ludzi. Jednak jego nowe istnienie jest dalekie od spokoju, a Rai wkrótce zostaje zmuszony do uratowania swoich nowych przyjaciół przed Unią, która ich porwała. Tymczasem M-21 – agent Unii, który odszedł od organizacji podczas operacji ratunkowej Raira – dołącza do personelu bezpieczeństwa szkoły średniej Ye Ran po propozycji dyrektora szkoły, którym okazuje się być sam Frankenstein. Na zewnątrz M-21 wydaje się być uprzejmym i poprawnym pracownikiem, ale w rzeczywistości jest związany swoimi dawnymi powiązaniami z Unią i nieuniknionymi konsekwencjami zdrady organizacji. Aby jeszcze bardziej skomplikować sprawę, Noblesse Regis K. Landegre i Seira J. Loyard zapisują się do tej samej szkoły, aby zbadać Noblesse. Podczas gdy Unia prowadzi poszukiwania M-21, aby uzyskać wskazówki dotyczące zaginionych agentów, Rai jest zmuszony do ukrywania swojej tożsamości, chroniąc wszystko, co mu drogie.