Fantomy to nadprzyrodzone istoty, takie jak duchy czy youkai, które do niedawna uważano za zwykłe przesądy. Jednak gdy wirus zakażający mózg rozpowszechnia się w społeczeństwie, postrzeganie świata przez ludzi się zmienia, a te mityczne istoty okazują się żyć obok ludzkości przez cały czas. Ten wirus ma również znaczący wpływ na następną generację, nadając jej specjalne zdolności do walki z niebezpiecznymi fantomami. Haruhiko Ichijou i Mai Kawakami to dwie osoby, które otrzymały taką moc. Haruhiko posiada zdolność przywoływania i zamykania fantomów za pomocą rysunków, podczas gdy Mai kieruje mocą żywiołów w sztuki walki. Razem z przyjaznym fantomem Ruru tworzą Zespół E w Akademii Hosea, organizacji zajmującej się tymi często psotnymi istotami. W świecie, w którym rzeczywistość i surrealistyczne elementy się splatają, radzą sobie z codziennymi problemami powodowanymi przez fantomy.