Kagura Mayo przenosi się do Akademii Fuuka, by odkryć, że zostaje tam uwięziona w niezniszczalnych kajdankach. W Fuuka spotyka Shizuru, Harukę, Yukino, Natsuki, Nao oraz liczne inne postacie z Mai-HiME. Dowiaduje się również, że Akademia Fuuka stanowi miejsce zebrań MiKO – dziewcząt posiadających zdolności psychokinetyczne, do których należy Mayo.