Magician's Academy koncentruje się na Takuto Hasegawie, studentzie akademii magii, która nie figuruje na żadnej mapie. Podczas egzaminu z zaklęcia przywołania przypadkowo przywołuje dziewczynę o imieniu Tanarotte. Posiada ona wystarczająco dużo mocy magicznej, by zniszczyć jego kraj, ale na szczęście Tanarotte przysięga mu wieczną lojalność (i miłość) jako swojemu "stworzycielowi".