Rinne Rokudou ma większe problemy niż chodzenie do szkoły – mianowicie pomaga duchom przejść do życia następnego. Z powodu tej odpowiedzialności często ma problemy z pieniędzmi i z trudem kupuje niezbędne rzeczy: jedzenie, ubrania oraz narzędzia do egzorcyzmów. Sakura Mamiya widziała duchy od najmłodszych lat. Mieniła nadzieję, że z wiekiem przestanie to robić, ale nawet po rozpoczęciu nauki w liceum nic się nie zmieniło. Co gorsza, gdy jej wiecznie nieobecny kolega z klasy, Rinne, po raz pierwszy pojawił się w szkole, tylko Sakura mogła go zobaczyć. Zakładała, jak każdy by zrobił, że jest on duchem. Jednak ku zdumieniu Sakury, następnego dnia Rinne normalnie uczęszczał do szkoły. Kyoukai no Rinne opisuje podróż Sakury, podczas której poznaje prawdziwą naturę Rinne oraz istnienie ukrytego świata nadprzyrodzonego.